Borrar directorios disco duro externo

Tengo un problema con el disco duro externo que conecto por USB al TV. Lo tenía lleno y decidí borrar películas y los directorios en las que las tenía ordenadas con el ordenador donde las grabo. Mi sorpresa fue que al conectarlo de nuevo al TV todos los subdirectorios que borré que tenía en el disco duro volvían a aparecer. Desde el televisor no puedo borrarlos porque los he grabado con el ordenador. Pero si lo veo desde el ordenador los subdirectorios no existen.
he probado a borrar historial de Smart-tv pero solo borra el historial de las web a las que me he conectado.
Probé a cambiar el nombre del disco duro y los subdirectorios siguen cuando lo conecto al TV.
¿Cómo se puede borrar la memoria del historial de los discos duros conectados al TV?